Футболистом «чёрно-жёлтой» команды Гюндоган является с 30 июня 2011 года, а до этого он выступал за «Нюрнберг».
В текущем сезоне игрок провел лишь три матча во всех турнирах и забил один гол. Все игры состоялись в августе, с тех пор он не играет из-за проблем с позвоночником.
